Vacíos de colección identificados en el acervo genético de Sorghum

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Se encontraron datos para 29 especies silvestres y 2 taxones intraespecíficos  (S. bicolor subsp. drummondii, S. bicolor subsp. arundinaceum), para un total de 31 taxones para analizar. Los taxones pertenecientes al acervo genético bajo análisis fueron clasificados según Stenhouse et al., (1997).

El set de datos (descargar) utilizado para los análisis contiene 4,337 observaciones, de las cuales 4,111 (95%) corresponden a especimenes de herbario y 226 (5%) a accesiones de bancos de germoplasma. El número promedio de registros totales por taxón fue 140 (desviación estándar de 426), indicando que los registros disponibles son relativamente abundantes, sin embargo se encuentran concentrados en algunos taxones (i.e. S. halepense [2,399], S. plumosum [276], S. stipoideum [226], S. bicolor subsp. arundinaceum [146], S. bicolor subsp. drummondii [147]). Taxones como S. pauciflorum (1), S. usorum (1) y S. somaliense (2), entre otros, tienen un muestreo muy limitado y/o disponibilidad de datos reducida y por lo tanto es necesaria más caracterización y muestreo con el fin de ejecutar evaluaciones ecogeográficas confiables con estas especies.

El análisis de vacíos para este acervo genético  mostró que hay 27 taxones , de un total de 31, que se encuentran subrepresentados o no representados en bancos de germoplasma,  estos taxones fueron clasificados como “Taxones de colección prioritaria”). 7 de estos taxones tienen 10 o menos registros (suma de herbario y germoplasma), lo cual indica que estas especies en particular requieren de más esfuerzos de colección (i.e. S. pauciflorum, S. usorum, S. aterrimum, S. miliaceum, S. somaliense, S. mjoebergii, S. trichocladum). Ninguna especie fue clasificada como “Muy bien conservada ex situ“, debido probablemente a la cantidad de datos a los que no se tuvo acceso y no fueron incluidos en el análisis. Las especies S. almum y S. purpureo-sericeum se encuentran relativamente poco conservadas y fueron clasificadas como “especies de prioridad media”, mientras que los tazones S. bicolor subsp. arundinaceum y S. bicolor subsp. drummondii son las más conservadas en el acervo genético.

Potential sampling zones

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Las especies de colección prioritaria para Sorghum están distribuidas en Asia central, parte de Oceanía, India y Africa. high priority taxa were found to be distributed in central Asia, part of Oceania, India and Africa. Las zonas en colores del mapa anterior, corresponden a las zonas en donde la especie puede encontrarse y aún no se ha colectado material para ser conservado ex situ.

Potential sampling richness

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Las zonas de alta riqueza potencial de colección se encuentran en el Northern Territory de Australia.

Breve descripción de los datos usados en el análisis

La siguiente tabla muestra el número de registros (herbario, germoplasma y total) usados para el análisis de vacíos, a nivel de especies y taxones intraespecíficos si es el caso.

En una primera etapa, la taxonomía de las especies fue revisada usando Maxted et Kell (2009), posteriormente en GRIN taxonomical y finalmente en Kew taxonomy database.  Después de la verificación y correción tanto de ortografía como sinonímias, se llevó a cabo un profundo proceso de georreferenciación con el fin de obtener una base de datos que almacenara la mayor cantidad posible de registros  por especie con información geográfica (i.e. coordenadas espaciales). Posteriormente, los registros que se encontraron por fuera de los límites continentales fueron eliminados y finalmente se obtuvo el set de datos para analizar.

Los datos de las siguientes 61 colecciones se encuentran libremente disponibles al público:

1. Árboles de la Península de Yucatán, Flora del Distrito de Tehuantepec, Oaxaca y Familia Asteraceae en México (IBUNAM)
2. Arizona State University Vascular Plant Herbarium
3. Australian National Herbarium (CANB)
4. BDBCV BioBlitz in Penyagolosa (Castellon, Spain)
5. Biodiversidad de Costa Rica
6. Bishop Museum Natural History Specimen Data
7. Botanical Society of the British Isles - Vascular Plants Database
8. Bundesamt fuer Naturschutz / Netzwerk Phytodiversitaet Deutschland
9. California State University, Chico
10. Database Schema for UC Davis [Herbarium Labels]
11. Direccion General de Investigacion, Desarrollo Tecnologico e Innovacion de la Junta de Extremadura(DGIDTI): HSS
12. EURISCO, The European Genetic Resources Search Catalogue
13. Fairchild Tropical Botanic Garden Virtual Herbarium Darwin Core format
14. FloVegSI - Floristical and fitocenological database of ZRC SAZU
15. Galapagos grasses and sedges
16. Herbario de la Universidad de Sevilla, SEV-Historico
17. Herbario del Instituto de Ecologia, A.C., México (IE-BAJIO)
18. Herbarium (UNA)
19. Herbarium GJO
20. Herbarium of Oskarshamn (OHN)
21. Herbarium Specimens of Bonin and Ryukyu Islands
22. Herbarium Specimens of Museum of Nature and Human Activities, Hyogo Pref., Japan
23. Herbarium Willing
24. Herbarium WU
25. Herbier de la Guyane
26. Hortus Botanicus Sollerensis Herbarium (FBonaf+¿)
27. ICRISAT SORGHUM
28. Instituto de Ciencias Naturales
29. IPK Genebank
30. Israel Nature and Parks Authority
31. Leiner-Herbar Konstanz
32. Lund Botanical Museum (LD)
33. MEXU/Plantas Vasculares
34. Missouri Botanical Garden
35. Natural History Museum Rotterdam (NMR)
36. New Zealand National Plant Herbarium (CHR)
37. Nordic Herbarium (S)
38. NSW herbarium collection
39. Observations du Conservatoire botanique national du Bassin parisien.
40. Phanerogamie
41. Plants (GBIF-SE:Artdatabanken)
42. Plants of Papua New Guinea
43. Real Jardin Botanico (Madrid), Vascular Plant Herbarium (MA)
44. Repatriacion de datos del Herbario de Arizona (ARIZ)
45. Specimen Database of Colorado Vascular Plants
46. The AAU Herbarium Database
47. The Deaver Herbarium, Northern Arizona University
48. The System-wide Information Network for Genetic Resources (SINGER)
49. United States National Plant Germplasm System Collection
50. Universidad de Almeria, HUAL
51. Universidad de Extremadura, UNEX
52. Universidad de Malaga: MGC-Cormof
53. University and Jepson Herbaria DiGIR provider
54. USDA PLANTS Database
55. USU-UTC Specimen Database
56. Utah Valley State College Herbarium
57. Vascular Plant Collection
58. Vascular Plant Collection - University of Washington Herbarium (WTU)
59. Vascular Plant Herbarium, Oslo (O)
60. Vascular Plant Type Specimens
61. Zoological specimens

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