Taxa de colección prioritaria

Los siguienes taxa (10 de 28) fueron identificados como taxa de colección prioritaria:

  • H. brachyantherum
  • H. capense
  • H. comosum
  • H. cordobense
  • H. erectifolium
  • H. flexuosum
  • H. fuegianum
  • H. guatemalense
  • H. procerum
  • H. tetraploidum

Ver toda la lista de prioridades aquí

Vacíos de colección identificados en el acervo genético de Hordeum

(ver descargas)

Se encontraron registros para  27 especies silvestres y 1 taxón intraespecífico (H. vulgare subsp. spontaneum). Los diferentes taxas están clasficados de la siguiente manera, de acuerdo a su cercanía la especie cultivada H. vulgare subsp. vulgare según Maxted and Kell (2009) como se muestra a continuación:

Acervo genético primario
Acervo genético secundario
Acervo genético terciario
H. vulgare subsp. spontaneum
H. bulbosum
H. murinum
H. pusillum
H. intercedens
H. euclaston
H. flexuosum
H. muticum
H. chilense
H. cordobense
H. stenostachys
H. pubiflorum
H. halophilum
H. comosum
H. jubatum
H. arizonicum
H. procerum
H. lechleri
H. marinum
H. secalinum
H. capense
H. bogdanii
H. roshevitzii
H. brevisubulatum
H. brachyantherum
H. depressum
H. guatemalense
H. erectifolium
H. tetraploidum
H. fuegianum
H. parodii
H. patagonicum

El set de datos (descargar) utilizado para los análisis contiene 12,627 observaciones, siendo 10,977 (87%) especímenes de herbario y 1,650 (13%) accesiones de bancos de germoplasma. El número promedio de registros por taxón fue de 451 (desviación estándar de 1,488), indicando que los registros son abundantes pero se encuentran concentrados en determinados taxa. H. secalinum, con un total de 7,797 registros (99% correspondiente especímenes de herbario y 1% a accesiones de bancos de germoplasma), H. bulbosum con un total de 1,457 (77% herbario y 23% germoplasma) y H. pusillum con 1409 (96% herbario y 4% germoplasma) son los taxa en donde la mayor parte de registros están concentrados. Otros taxa como H. guatemalense (3), H. erectifolium (5), H. capense (9)fueron identificados como poco colectados, poco georreferenciados o poco caracterizados y por lo tanto requieren de muestros más extensivos con el fin de elaborar una caracterización ecogeográfica.

El análisis de vacíos en el acervo genético de Hordeum encontró que 10 taxa (H. brachyantherum, H. capense, H. comosum, H. cordobense, H. erectifolium, H. flexuosum, H. fuegianum, H. guatemalense, H. procerum, H. tetraploidum) se encuentran subrepresentados o no representados en bancos de germoplasma, por lo cual fueron considerados como especies de alta prioridad para su colecta. 6 taxa (H. arizonicum, H. depressum, H. euclaston, H. intercedens, H. pusillum y H. secalinum) fueron considerados de prioridad media; mientras que 10 taxa se encuentran relativamente bien conservados (H. bogdanii, H. brevisubulatum, H. bulbosum, H. lechleri, H. muticum, H. parodii, H. pubiflorum, H. roshevitzii, H. stenostachys, H. vulgare subsp. spontaneum). Sólo dos taxa fueron considerados bien conservados (H. chilense and H. patagonicum).

A continuación se presentan las zonas de colecta potencial para las especies de colección prioritaria:

Potential sampling richness

GE View in Google Earth

Potential sampling zones

GE View in Google Earth

Los taxa de colección prioritaria de Hordeum se encuetran distribuidos en Norte América (región occidental de Canadá y EEUU) y Sur América (Bolivia, chile y Argentina). Las zonas resaltadas en las figuras anteriores corresponden a las zonas en donde la especie puede encontrarse y aún no se han colectado accesiones para su conservación en bancos de germoplasma.

Breve descripción de los datos usados en el análisis

El centro de diversidad del acervo genético de Hordeum se encuentra en el suroccidente asiático, Asia central, Oeste de Norte América y Sur de Sur América. Se encuentra ampliamente distribuido en áreas templadas de ambos hemisferios. La siguiente tabla muestra el número de registros (herbario, germoplasma y total) usados por cada especie para el análisis de vacíos del acervo genético de Hordeum.

Especie
Germoplasma
Herbario
Total
Hordeum brachyantherum
125
547
672
Hordeum capense
9
0
9
Hordeum comosum
3
10
13
Hordeum cordobense
12
0
12
Hordeum erectifolium
5
0
5
Hordeum flexuosum
23
2
25
Hordeum fuegianum
42
0
42
Hordeum guatemalense
3
0
3
Hordeum procerum
21
0
21
Hordeum tetraploidum
23
3
26
Hordeum bogdanii
65
1
66
Hordeum brevisubulatum
22
4
26
Hordeum bulbosum
327
1130
1457
Hordeum lechleri
92
0
92
Hordeum muticum
65
12
77
Hordeum parodii
73
0
73
Hordeum pubiflorum
33
15
48
Hordeum roshevitzii
37
0
37
Hordeum stenostachys
100
6
106
Hordeum vulgare subsp. spontaneum
168
0
168
Hordeum arizonicum
19
15
34
Hordeum depressum
57
96
153
Hordeum euclaston
30
8
38
Hordeum intercedens
18
26
44
Hordeum pusillum
58
1351
1409
Hordeum secalinum
49
7748
7797
Hordeum chilense
69
3
72
Hordeum patagonicum
102
0
102

En una primera etapa, la taxonomía de las especies fue verificada usando Maxted and Kell (2009), posteriormente en GRIN taxonomical y finalmente en Kew taxonomy database . Después de la verificación y corrección tanto de ortografía como de sinonímias, se llevó a cabo un profundo proceso de georreferenciación con el fin de obtener una base de datos que almacenara la mayor cantidad posible de registros  por especie con información geográfica (i.e. coordenadas espaciales). Posteriormente, los registros que se encontraron por fuera de los límites continentales fueron eliminados y finalmente se obtuvo el set de datos para analizar y el set de datos final fue producido para los análisis (descargar set de datos).

Estas son las siguientes 66 colecciones cuyos datos se encuentran libremente disponibles:

  1. Arizona State University Vascular Plant Herbarium
  2. Artenvielfalt im Beckerbruch (Dessau)
  3. Artenvielfalt Kreis Giessen
  4. Auf Feld und Wiese / Bretlebener Weg (AWO - Kita Heldrungen)
  5. Australian National Herbarium (CANB)
  6. Botánica, Universidad de León: LEB-Cormo
  7. Botanical Society of the British Isles - Vascular Plants Database
  8. Bundesamt fuer Naturschutz / Netzwerk Phytodiversitaet Deutschland
  9. California State University, Chico
  10. Canadian Museum of Nature Herbarium
  11. CGN-PGR
  12. CONN GBIF data
  13. Database Schema for UC Davis [Herbarium Labels]
  14. Dirección General de Investigación, Desarrollo Tecnológico e Innovación de la Junta de Extremadura(DGIDTI): HSS
  15. Eintauchen in die Natur /Harraser Weg (AWO - Kita Oberheldrungen)
  16. Environment and Heritage Service - EHS Species Datasets
  17. Eppingen und Umgebung
  18. EUNIS
  19. EURISCO, The European Genetic Resources Search Catalogue
  20. Freigelaende Naturschutzscheune Reinheimer Teich (Kreis Darmstadt-Dieburg)
  21. Herbario de la Universidad de Salamanca: SALA
  22. Herbario de la Universidad de Sevilla, SEV
  23. Herbarium (UNA)
  24. Herbarium of Oskarshamn (OHN)
  25. Herbarium Willing
  26. inatura - Erlebnis Naturschau Dornbirn
  27. Internation Botanical Collections (S)
  28. Inventaire national du Patrimoine naturel (INPN)
  29. IPK Genebank
  30. Israel Nature and Parks Authority
  31. Jardín Botánico de Córdoba: Herbarium COA
  32. LaBoOb02
  33. Limnodata
  34. Lund Botanical Museum (LD)
  35. Missouri Botanical Garden
  36. National Vegetation Data bank
  37. Natural History Museum Rotterdam (NMR)
  38. NMNH Botany Collections
  39. Nordic Genetic Resources
  40. Observations du Conservatoire botanique national du Bassin parisien.
  41. Real Jardin Botanico (Madrid), Vascular Plant Herbarium (MA)
  42. Repatriación de datos del Herbario de Arizona (ARIZ)
  43. Rund um den Eichwald, Schulhof Friedrich Froebel Gymnasium- Bad Blankenburg
  44. Schulhof Sandhofenschule (Mannheim)
  45. seeds collected during expeditions, traditional culitvars and landraces are included
  46. Staatliches Museum fuer Naturkunde Stuttgart, Herbarium
  47. Take a Pride in Fife Environmental Information Centre - Records for Fife from TAPIF EIC
  48. The Deaver Herbarium, Northern Arizona University
  49. The System-wide Information Network for Genetic Resources (SINGER)
  50. UAM Botany Specimens
  51. Umgebung der Gesamtschule Hamburg-Winterhude
  52. United States National Plant Germplasm System Collection
  53. Universidad de Extremadura, UNEX
  54. Universidad de Granada, Herbario: GDA
  55. Universidad de Málaga: MGC-Cormof
  56. Universidad de Oviedo. Departamento de Biología de Organismos y Sistemas: FCO
  57. University and Jepson Herbaria DiGIR provider
  58. USDA PLANTS Database
  59. USU-UTC Specimen Database
  60. Utah Valley State College Herbarium
  61. Vascular Plant Collection
  62. Vascular Plant Collection - University of Washington Herbarium (WTU)
  63. Vascular Plant Herbarium, Oslo (O)
  64. Vascular Plant Type Specimens
  65. Vorderer Tiergarten (Dessau)
  66. VSN-Wiese

Descargas

Modelo de nicho climático para H. arizonicum
Zonas de colecta potencial para Hordeum
Riqueza de sitios de colección potenciales para Hordeum
Riqueza potencial de especies bajo condiciones climáticas actuales
Riqueza potencial de especies bajo condiciones climáticas futuras (año 2050, escenario SRES-A2a)
Cambios en la riqueza potencial de especies debido al cambio climático
Densidad de muestras (tamaño de celda: 200km) para las accesiones de germoplasma
Densidad de muestras (tamaño de celda: 200km) para los registros de herbario
Lista de prioridades de conservación para el acervo genético de Hordeum
Set de datos utilizados para este análisis

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3 Comments to “Acervo genético de Hordeum

  1. Jose Piggin says:

    Why don’t H. murinum and H. marinum appear in the lists? Surely there must have been specimens of these taxa in the databases sampled in your survey - and they are interesting since their ranges overlap with H. bulbosum and H. vulgare ssp spontaneum.

  2. @Jose

    You are spot on with your comment

    The European barley database lists 176 Hordeum murinum and 79 H. marinum accessions.

    The query is a bit crude and slow by today’s standards but it delivers the goods;)

    http://barley.ipk-gatersleben.de/ebdb.php3

  3. Julian says:

    We discarded them on the wild relative stuff as we are including them on the cropped accessions gap analysis, which protocol is being currently developed and refined in order to be published on this site.

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